来源：中国税务网-江苏省盐城市阜宁县地方税务局
一、医疗机构行业税收征管存在问题
1、纳税意识淡薄。由于自收自支的事业单位、社会团体、民办非企业单位涉及税收政策较以往有所变化，有些收费单位需领用地税部门发票按规定办理了税务登记、依法申报纳税，而部分医院至今未能办理税务登记、未按期纳税申报、未按规定办理涉税事项等情况，纳税意识淡薄。
2、财务管理不规范。有部分非营利企业单位财务管理很不规范，财务人员配备不规范，尚有其他非财会专业人员代为核算单位帐务，单位收支均可以白条、收据代替发票计帐，对是否应纳入财政收支项目、应填开财政性票据的，是否应按规定填开服务性票据，应申报纳税的收费不能相辨别收支混乱。
3、政策执行不到位。根据税法有关规定被认定为非营利组织，按规定价格取得的服务收入免征各项税收，不按规定取得的不得享受免税政策，由于单位收费价格组成较复杂，较专业，税务机关难以监控，同时非营利组织应依申请后，审核、审批为多部门，需多部门按规定协作，某种程度不仅仅为税务部门做得到。
二、医疗机构行业税收征管建议
1、加大税法宣传和纳税辅导力度。进一步加强事业单位、社会团体及民办非企业单位相关税收政策的宣传，加强对纳税人税收业务培训及辅导，提高纳税人业务水平，增强纳税人的纳税意识，促进其知法懂法，优化税收环境。
2、强化发票管理以规范发票使用。强化发票管理方面有关政策规定的宣传培训工作，使纳税人在取得应税服务收入、及支出的各项费用时均按规定填开发票或取得合规发票，适时地组织发票专项检查，及时查处发票违章行为。
3、规范年度检查行为。根据〈〈民办非企业单位登记管理暂行条例〉〉、〈〈非营利经济组织的认定及管理〉〉的有关管理规定，除相关部门组织年度检查，严格把关外，应由该单位的业务主管单位负责牵头不定期抽查行业运营状况，实现实时监控作用。
4、加大处罚力度。定期开展行业税收专项检查，切实加强对涉税违法行为的处罚力度，增加其因违法违规造成少缴税款的成本支出。同时对违法行为的加大公告曝光力度，可对那些情节严重，多次违规的单位进行曝光，将其偷逃税行为公示于众，从而提高其税法遵从度
