1.增值税方面
（1）废旧物资回收经营企业是否符合享受免税政策的条件，是否有特殊行业证书，是否存在个体经营者或其他个人违规享受免税政策的情况。
（2）废旧物资回收经营企业收购业务是否真实，收购发票的开具对象是否符合规定，有无从生产企业收购边角料不索取增值税专用发票或普通发票而开具收购发票的情况，开具的废旧物资收购发票的票面货物与实际货物是否一致，金额及数量是否真实，是否存在虚抬收购价格、虚报收购数量的情况。
（3）废旧物资回收经营企业销售业务是否真实；开具的普通发票是否规范，金额及数量是否真实，是否存在虚开普通发票的行为，销售的废旧物资数量、种类与其经营规模、职工人数等是否相应。对存在疑点的，要仔细核查其销售与货款收入情况，核查其损益情况，检查是否有真实交易，还可进一步检查其下游用废企业购进业务是否真实，金额及数量是否真实，是否存在虚抵进项税额的行为；同时检查用废企业是否按规定开具增值税专用发票，有无虚开增值税专用发票的行为。
（4）废旧物资回收经营企业是否存在为用废企业虚开废旧物资收购发票或虚开普通发票的行为，是否存在收取代开管理费、手续费的情况。重点检查：有无购销合同，合同购买方是否与收票单位名称一致；是否销售了发票注明货物，帐本上有无记载；是否收到货款以及收到货款的资金支付方式；货物从销售方到购货方的运输方式，有无运费记录。
2.企业所得税方面
（1）各项应税收入不真实、完整而不缴或少缴税款的。重点检查各种应税收入是否全部按规定入帐，有无已实现收入不确认、长期挂往来或不入帐的情况。
（2）税前扣除项目是否真实、合法。重点检查各项准备金、风险金、业务招待费、广告费、租赁费、工资及相关费用、资产损失、捐赠支出、改扩建及装修工程支出、管理费等项目。
